В севообороте возвращение клещевины на прежнее поле не ранее как через 3—4 года, а при выявлении фузариоза — через 8—10 лет.
Сбор семян со здоровых участков, тщательная их очистка и протравливание.
Сеять клещевину необходимо в оптимальные сроки, когда температура почвы на глубине заделки семян достигает 12—14°.
Первый раз опрыскивают при образовании первых настоящих листьев, второй — в начале появления мак-роспориоза, фитофтороза или бактериоза, а третий — при появлении гнили соцветий. В случае необходимости рекомендуется дополнительное опрыскивание (через 10— 15 дней после второго), но не позже чем за 20 дней до уборки урожая.
На семенных участках перед уборкой выбраковывать растения, пораженные фузариозным увяданием. И.х удаляют с поля и сжигают.